擅自设立金融机构罪的认定，主要依据相关法律法规，重点在于是否未经国家有关主管部门批准，擅自设立从事金融业务的机构。
擅自设立金融机构罪，是指未经国家有关主管部门批准，擅自设立商业银行、证券交易所、期货交易所、证券公司、期货经纪公司、保险公司或者其他金融机构的行为。
在认定该罪时，首先要明确“擅自设立”的含义。“擅自”强调的是未经合法授权或批准，行为人自行决定并实施设立金融机构的行为。“设立”不仅包括从头开始创建全新的金融机构，还包括对已存在但未经批准的金融机构进行改组、合并等操作，使其以新的形式出现。
对于“金融机构”的界定也至关重要。一般来说，金融机构是指从事金融业务、具有金融属性和功能的机构，如商业银行、证券公司、保险公司等。这些机构通常受到国家严格的监管和准入制度的约束。
此外，“未经国家有关主管部门批准”是构成此罪的关键要素。国家有关主管部门会根据相关法律法规和政策，对设立金融机构进行审批和管理。如果行为人未获得这种批准而擅自设立金融机构，就可能构成犯罪。
在司法实践中，判断是否构成擅自设立金融机构罪，还需要综合考虑行为人的主观故意、设立的金融机构的规模和业务范围、对金融秩序造成的危害程度等因素。如果行为人主观上具有故意，明知设立金融机构需要经过批准而故意未经批准实施设立行为，并且其设立的金融机构在一定范围内开展了金融业务，对金融秩序产生了实质性的危害，那么就应当认定为擅自设立金融机构罪。
例如，某人为了获取非法利益，在没有获得金融监管部门批准的情况下，私自开设一家所谓的“投资公司”，向公众吸收资金并承诺高额回报。这种行为就属于擅自设立金融机构，严重扰乱了金融秩序，应当以擅自设立金融机构罪追究其刑事责任。
需要注意的是，随着金融创新的不断发展，对于一些新兴的金融业态和模式，在认定是否构成擅自设立金融机构罪时，需要结合具体情况，依据法律法规的精神和目的进行准确判断，以确保法律的正确适用和金融秩序的稳定。
法律依据：
《中华人民共和国刑法》
第一百七十四条未经国家有关主管部门批准，擅自设立商业银行、证券交易所、期货交易所、证券公司、期货经纪公司、保险公司或者其他金融机构的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处二万元以上二十万元以下罚金;情节严重的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金。
单位犯前两款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照第一款的规定处罚。
