非法杀害国家二级保护动物一只即构成犯罪，会被立案。
国家重点保护的野生动物分为一级和二级，保护动物是大自然的重要组成部分，对于维护生态平衡、提供生态服务、促进经济发展、保护文化遗产以及履行道德责任都具有极其重要的意义。
根据我国相关法律规定，非法猎捕、杀害国家重点保护的珍贵、濒危野生动物的，或者非法收购、运输、出售国家重点保护的珍贵、濒危野生动物及其制品的，都属于违法犯罪行为。对于国家二级保护动物，只要非法杀害一只，就达到了刑事立案的标准。
需要明确的是，法律之所以对此作出严格规定，是因为保护动物的生存状况关系到整个生态系统的稳定和平衡。每一种保护动物在其所处的生态环境中都扮演着特定的角色，它们的数量减少或灭绝可能会引发一系列连锁反应，对生态环境造成不可逆转的损害。
同时，对于非法杀害保护动物的行为，在定罪量刑时，会综合考虑犯罪的性质、情节、危害后果等因素。比如，杀害的手段是否特别残忍，是否存在多次杀害的情况，是否有组织地进行犯罪活动等等。
保护野生动物，不仅是法律的要求，更是我们每个人应尽的责任和义务。我们应当树立保护野生动物的意识，积极参与到保护野生动物的行动中来，共同维护地球家园的生态平衡和生物多样性。
法律依据：
《中华人民共和国刑法》第三百四十一条《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定(一)》第六十四条
