非法占用农用地罪的立案标准主要包括非法占用基本农田五亩以上或者非法占用基本农田以外的耕地十亩以上、非法占用防护林地或者特种用途林地数量单种或者合计五亩以上、非法占用其他林地十亩以上等情形。
非法占用农用地罪是指违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的行为。
根据相关法律规定和司法解释，以下是非法占用农用地罪的最新立案标准：
1. 非法占用基本农田五亩以上或者非法占用基本农田以外的耕地十亩以上的。基本农田是国家重点保护的耕地资源，对于保障国家粮食安全具有至关重要的作用。非法占用达到一定面积，即构成犯罪。
2. 非法占用防护林地或者特种用途林地数量单种或者合计五亩以上的。防护林地和特种用途林地具有特殊的生态功能和重要的生态价值，对其非法占用会严重破坏生态环境。
3. 非法占用其他林地十亩以上的。其他林地同样是生态系统的重要组成部分，大量非法占用会对生态平衡造成损害。
4. 非法占用上述规定的农用地，分别达到上述数量标准的百分之五十以上，且两项合计数量达到该项规定的数量标准的。
5. 非法占用农用地，造成上述农用地毁坏的。这里的毁坏包括种植条件严重毁坏或者严重污染等情况。
需要注意的是，对于非法占用农用地的行为，不仅要考虑占用的面积，还要综合考虑占用的方式、用途以及造成的后果等因素。在司法实践中，对于此类案件的认定，会依据具体的证据和法律规定进行严格审查和判断。
总之，保护农用地是维护国家生态安全和粮食安全的重要任务，对于非法占用农用地的行为，应当依法予以严厉打击。
法律依据：
《刑法》第三百四十二条，违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
第十四条，明知自己的行为会发生危害社会的结果，并且希望或者放任这种结果发生，因而构成犯罪的，是故意犯罪。
故意犯罪，应当负刑事责任。
