非法集资案件中的员工处理方式需根据其在犯罪中的作用、参与程度、主观故意等因素综合判断。一般来说，可能会面临行政处罚、刑事处罚或免于处罚。
非法集资是一种严重的经济犯罪行为，对于参与其中的员工，处理方式较为复杂，需要综合多方面的因素进行考量。
首先，要明确员工在非法集资活动中的具体角色和职责。如果员工只是被蒙蔽，对非法集资的性质并不知情，且在工作中没有起到重要作用，那么可能会免于刑事处罚，但仍可能面临一定的行政处罚，如罚款等。
对于那些在非法集资活动中起到积极推动作用，如参与策划、组织、宣传、招揽客户等重要环节的员工，其行为可能构成犯罪。根据相关法律规定，他们可能会被追究刑事责任，包括但不限于拘役、有期徒刑，并可能被处以罚金。
在判断员工的责任时，司法机关通常会考虑员工的主观故意。如果员工明知是非法集资活动仍积极参与，那么其主观恶性较大，处罚也相对较重；如果员工是在受到欺骗、胁迫或者误解的情况下参与，可能会从轻处罚。
此外，员工的涉案金额也是一个重要的考量因素。涉案金额越大，造成的社会危害越严重，相应的处罚也会越严厉。
值得注意的是，在一些情况下，即使员工在非法集资活动中的直接作用较小，但如果其多次参与或者协助主要犯罪分子，也可能会被认定为共犯而受到刑事处罚。
总之，对于非法集资案件中的员工处理，需要综合各种因素，依法进行公正、合理的判断和裁决。
法律依据：
《中华人民共和国刑法》第二十七条、第一百七十六条《最高人民法院关于审理非法集资刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第一条、第二条
