民事诉讼在一定条件下可以对行政行为的合法性进行审查和否定。
在民事诉讼中，能否否定行政行为需要具体情况具体分析。一般而言，如果行政行为是民事诉讼中的基础或关联事实，且该行政行为的合法性直接影响到民事诉讼的结果，那么民事诉讼有可能对行政行为进行一定程度的审查和评判。
例如，在一些涉及产权纠纷的民事诉讼中，如果行政机关对相关产权的登记或认定存在明显错误或违法，而这一行政行为直接影响了民事诉讼中当事人的权利义务关系，那么法院可能会对该行政行为的合法性进行审查。
然而，民事诉讼对行政行为的审查通常是有限的。法院主要是从民事法律关系的角度出发，判断行政行为对民事案件的影响，而不是像行政诉讼那样全面、深入地审查行政行为的合法性。
此外，民事诉讼中否定行政行为还需要遵循相关的法律程序和原则。法院在审查时，应当尊重行政机关的职权范围和行政程序，不能超越自身的权限替代行政机关作出行政决定。
需要注意的是，为了避免民事诉讼与行政诉讼之间的冲突和混乱，我国法律在制度设计上也有一些相应的规定和协调机制。例如，在某些情况下，法院可能会中止民事诉讼，等待相关行政争议通过行政诉讼解决后再继续审理民事案件。
总之，民事诉讼能否否定行政行为并非一概而论，而是要根据具体案件的情况、法律规定以及司法实践中的操作原则来综合判断。
法律依据：
依据《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第二条规定当事人对自己提出的诉讼请求所依据的事实或者反驳对方诉讼请求所依据的事实有责任提供证据加以证明。
