非法经营罪的立案标准包括：个人非法经营数额在五万元以上，或者违法所得数额在一万元以上；单位非法经营数额在五十万元以上，或者违法所得数额在十万元以上；虽未达到上述数额标准，但两年内因同种非法经营行为受过二次以上行政处罚，又进行同种非法经营行为的等。
非法经营罪是指违反国家规定，从事非法经营活动，扰乱市场秩序，情节严重的行为。其立案标准在不同的情形下有所区别。
首先，从非法经营的数额来看，个人非法经营数额在五万元以上，或者违法所得数额在一万元以上的，应当予以立案追诉。单位非法经营数额在五十万元以上，或者违法所得数额在十万元以上的，达到立案标准。
其次，存在虽未达到上述数额标准，但两年内因同种非法经营行为受过二次以上行政处罚，又进行同种非法经营行为的情况，也会被立案。这意味着对于屡教不改的非法经营者，即便其单次经营数额或违法所得未达到较高标准，也可能被追究刑事责任。
另外，非法经营活动的类型也会影响立案标准。比如，未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品或者其他限制买卖的物品。常见的如烟草专卖品，如果未经许可经营烟草专卖品，其立案标准会根据具体的经营数额和情节来确定。
再如，买卖进出口许可证、进出口原产地证明以及其他法律、行政法规规定的经营许可证或者批准文件。这种情形下，只要实施了相关行为，情节严重的，即达到立案标准。
还包括未经国家有关主管部门批准非法经营证券、期货、保险业务，或者非法从事资金支付结算业务等。每种具体的非法经营行为，在考虑是否达到立案标准时，都会综合经营数额、违法所得、经营次数、社会危害程度等多方面因素。
需要注意的是，法律规定会根据社会经济的发展和实际情况进行调整和完善，对于具体案件中的非法经营行为是否达到立案标准，需要依据当时有效的法律法规和司法实践中的具体情况来准确判断。
法律依据：
《中华人民共和国刑法》第二百二十五条《最高人民检察院公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（二）》第七十九条
