侵占耕地三亩的处罚方式会根据具体的情节和相关法律法规来确定，可能面临行政处罚甚至刑事处罚。
侵占耕地是一种严重的违法行为。根据我国相关法律法规，对于侵占耕地三亩的行为，处罚方式取决于多种因素，包括侵占的目的、造成的后果、当事人的主观过错等。
如果侵占耕地的行为是出于未经批准的建设、堆放杂物等非农业建设目的，可能会面临行政处罚。土地行政主管部门会责令退还非法占用的耕地，限期拆除在非法占用的耕地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状，并可以处以罚款。
如果侵占耕地的行为造成耕地大量毁坏，或者情节特别严重的，可能构成刑事犯罪。依照我国《刑法》规定，违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
在判断是否“数量较大”和“造成耕地大量毁坏”时，通常会参考相关的司法解释和标准。对于侵占三亩耕地的情况，如果符合上述标准，就有可能被追究刑事责任。
此外，即使不构成刑事犯罪，当事人也需要承担相应的民事赔偿责任，对被侵占耕地所造成的损失进行赔偿。
总之，保护耕地是关系到国家粮食安全和生态平衡的重要任务，任何单位和个人都不得非法侵占耕地。
法律依据：
《刑法》第三百四十二条 违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成耕地、林地等农用地大量毁坏的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
